二、規(guī)范農(nóng)民專業(yè)合作社涉稅管理的幾點建議
　　1.做好政策宣傳和納稅輔導工作。要有計劃的對一線農(nóng)村稅務管理員開展業(yè)務培訓，幫助他們熟悉和掌握關于農(nóng)民專業(yè)合作社的法律法規(guī)和稅收政策，只有一線農(nóng)村稅務管理員真正吃透相關法規(guī)政策，才能做好農(nóng)民專業(yè)合作社的征收管理工作。同時，各級稅務機關，尤其是農(nóng)村稅務所（分局）要加強政策宣傳和納稅輔導，將關于專業(yè)合作社的法律法規(guī)和稅收政策采取各種方式，幫助其吃透政策、用好用對稅收優(yōu)惠。此外，各縣（區(qū)）局和農(nóng)村稅務所（分局）應積極開展政策輔導和辦稅輔導，幫助提高會計核算水平和自主辦稅能力，引導農(nóng)民專業(yè)合作社提高依法納稅意識，嚴格遵照稅收政策規(guī)定處理涉稅事宜，輔導農(nóng)民專業(yè)合作社按照國務院財政部門制定的財務會計制度設置會計賬簿，自主健全會計核算，按照法律規(guī)定設置成員交易管理臺賬，以合法有效的憑證如實核算，區(qū)別不同的交易方式進行分別核算，分別核算內(nèi)部交易和對外銷售，自產(chǎn)產(chǎn)品和成員產(chǎn)品、非成員產(chǎn)品分別核算，應稅收入和免稅收入分別核算，做到會計核算規(guī)范、完整、合法、準確。
　　2.認定免稅資格，保證涉稅信息準確。應定期從工商部門取得開業(yè)的農(nóng)民專業(yè)合作社信息，進行調(diào)查核實，對超期未辦理稅務登記的，應及時與企業(yè)溝通，責令其補辦稅務登記，納入正常稅收管理。對農(nóng)民專業(yè)合作社提出免稅資格申請的，應堅持實地調(diào)查與資料備案同步，符合免稅條件的收入審批免稅，不符合條件的，按規(guī)定及時征收稅款。
　　3.修改完善稅收征管系統(tǒng)相關模塊。對農(nóng)民專業(yè)合作社涉稅信息采集中關鍵是對農(nóng)民專業(yè)合作社的行業(yè)分類和稅種核定進行明確，結(jié)合綜合征管軟件系統(tǒng)和增值稅免稅農(nóng)產(chǎn)品規(guī)定的要求，將其列入“批發(fā)業(yè)”中的“農(nóng)畜產(chǎn)品批發(fā)”或“食品、飲料及煙草制品批發(fā)”等類別比較合適，如果以加工為主的，也可以列入“制造業(yè)”中的“農(nóng)副食品加工業(yè)”的有關類別；對綜合征管軟件系統(tǒng)的相關模塊進行必要的調(diào)整，完善稅務登記表格和內(nèi)容、農(nóng)民專業(yè)合作社免稅資格認定項目等，增加免稅項目類型和免稅項目原因等文書審批選項。
4.規(guī)范發(fā)票使用規(guī)定，加強發(fā)票管理和審核。農(nóng)民專業(yè)合作社既可以收購其成員和非成員的產(chǎn)品對外銷售，又可以向其成員和非成員銷售生產(chǎn)資料等，其成員具有一定的相對獨立性，與所屬農(nóng)民專業(yè)合作社存在交易和結(jié)算關系，因此在發(fā)票的使用上建議上級明確規(guī)定農(nóng)民專業(yè)合作社收購其成員和非成員的產(chǎn)品均可以開具農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票，如果農(nóng)民專業(yè)合作社是增值稅一般納稅人的收購其成員產(chǎn)品開具的農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票不允許抵扣，向其成員和非成員銷售生產(chǎn)資料、對外銷售產(chǎn)品均可以開具普通銷售發(fā)票或增值稅專用發(fā)票，只是應稅收入和免稅收入分開核算，免稅收入不得開具增值稅專用發(fā)票。
　　5.細化或補充政策規(guī)定，增強政策執(zhí)行的準確性。建議將農(nóng)民專業(yè)合作社作為一個農(nóng)業(yè)生產(chǎn)單位整體對待，與現(xiàn)行增值稅政策保持一致，只有自產(chǎn)與非自產(chǎn)的區(qū)分，農(nóng)民專業(yè)合作社本身生產(chǎn)的和成員生產(chǎn)的都視同自產(chǎn)農(nóng)產(chǎn)品，明確規(guī)定銷售自產(chǎn)農(nóng)產(chǎn)品和成員自產(chǎn)農(nóng)產(chǎn)品均免征增值稅。在企業(yè)所得稅方面，可以考慮加大優(yōu)惠政策力度，比照高新技術企業(yè)等的規(guī)定，對農(nóng)民專業(yè)合作社作為一個納稅主體，直接免征企業(yè)所得稅或者按照15%的低稅率征收企業(yè)所得稅。
　　6.構(gòu)建農(nóng)民專業(yè)合作社稅收征管長效機制?？h（區(qū)）局和農(nóng)村稅務所（分局）應做好與當?shù)剞r(nóng)業(yè)主管部門相關管理機構(gòu)的信息溝通工作，及時對相關農(nóng)業(yè)專業(yè)合作社可能的農(nóng)產(chǎn)品產(chǎn)量，提供勞務的能力等進行科學合理的評估，確保交易的真實性。由于增值稅一般納稅人從農(nóng)民專業(yè)合作社購進的免稅農(nóng)業(yè)產(chǎn)品，可按13%的扣除率計算抵扣增值稅進項稅額，專業(yè)合作社的發(fā)票使用管理和交易的真實性顯得尤其重要。稅收管理員要加強農(nóng)民專業(yè)合作社開具發(fā)票的交易行為的審核力度，通過對可能生產(chǎn)的農(nóng)業(yè)產(chǎn)品的品種、年度產(chǎn)量進行評估，來評價其交易行為的真實程度，監(jiān)督其按照真實的交易行為和交易時間如實開具發(fā)票，防止通過虛構(gòu)經(jīng)營業(yè)務進行虛開、代開、變換產(chǎn)品名稱開具、超范圍開具等現(xiàn)象的發(fā)生，監(jiān)控其如實核算免稅收入，避免下游環(huán)節(jié)多抵扣進項稅額，減少國家稅款的流失。
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